在一个RFID系统中，编码模式的选择要考虑电子标签能量的来源、检错的能力、时钟的提取等多斱面因素。每一种编码模式都有某方面的优点，实际应用中要综合考虑、兼顾选择。
(1)13.56MHz的ISO/IEC14443标准
ISO/IEC 14443标准采用13.56MHz频率。根据信号发送和接收模式的不同，ISO/IEC14443定义了TYPE A和TYPE B两种类型。
①对于读写器到电子标签的数据传输，TYPE A型采用改进的Miller编码，TYPE B型采用NRZ编码。
②对于电子标签到读写器的数据传输，TYPE A型采用Manchester编码，TYPE B型采用NRZ编码。
(2)433MHz的ISO18000-7标准
ISO18000-7标准采用433MHz频率。
①对于读写器到电子标签的数据传输，采用Manchester编码。
②对于电子标签到读写器的数据传输，也采用Manchester编码。
(3)860/960MHz的ISO18000-6标准
ISO18000-6标准采用860/960MHz频率。根据信号发送和接收模式的不同，ISO18000-6标准定义了18000-6 A、18000-6 B和18000-6 C共3种类型。
① 对于读写器到电子标签的数据传输，18000-6 A采用PIE编码，18000-6 B采用Manchester编码，18000-6 C采用PIE(取反)编码。
② 对于电子标签到读写器的数据传输，18000-6 A采用FM0编码，18000-6 B采用FM0编码，18000-6 C采用FM0编码。
(4)2450MHz的ISO18000-4标准
ISO18000-4标准采用2450MHz频率。根据信号发送和接收模式的不同，ISO18000-4标准定义了18000-4 mode1和18000-4 mode2两种类型。这里只给出18000-4 mode1的情况。
①对于读写器到电子标签的数据传输，18000-4 mode1采用Manchester编码。
②对于电子标签到读写器的数据传输，18000-4 mode1采用FM0编码。